Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms