Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2aP34056 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms