Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifnar1P33896 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifnar1P33896 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms