Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms