Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms