Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms