Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms