Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms