Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprmP28828 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprmP28828 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprmP28828 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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