Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Hoxd10P28359 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms