Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms