Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CebpbP28033 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms