Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrg3P27681 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms