Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xrcc5P27641 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Xrcc5P27641 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Xrcc5P27641 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Xrcc5P27641 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Xrcc5P27641 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xrcc5P27641 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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