Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpbP27048 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms