Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms