Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CftrP26361 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CftrP26361 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CftrP26361 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CftrP26361 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CftrP26361 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CftrP26361 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CftrP26361 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CftrP26361 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CftrP26361 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CftrP26361 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CftrP26361 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CftrP26361 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CftrP26361 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CftrP26361 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CftrP26361 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CftrP26361 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CftrP26361 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CftrP26361 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CftrP26361 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CftrP26361 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CftrP26361 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CftrP26361 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CftrP26361 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CftrP26361 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CftrP26361 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CftrP26361 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CftrP26361 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CftrP26361 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CftrP26361 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CftrP26361 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CftrP26361 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CftrP26361 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CftrP26361 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CftrP26361 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CftrP26361 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CftrP26361 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CftrP26361 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CftrP26361 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CftrP26361 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CftrP26361 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CftrP26361 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CftrP26361 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CftrP26361 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CftrP26361 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CftrP26361 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CftrP26361 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms