Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtmaP26350 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtmaP26350 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms