Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf1bP25119 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms