Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf239P24399 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms