Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZfaP23607 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms