Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms