Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcb1aP21447 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms