Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prim1P20664 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim1P20664 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prim1P20664 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms