Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SagP20443 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SagP20443 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SagP20443 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SagP20443 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SagP20443 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SagP20443 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SagP20443 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SagP20443 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SagP20443 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SagP20443 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms