Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou5f1P20263 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou5f1P20263 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms