Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P20040 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P20040 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P20040 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P20040 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P20040 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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