Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms