Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18532 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18532 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18532 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18532 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18532 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms