Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd48P18181 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd48P18181 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd48P18181 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms