Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmga1P17095 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hmga1P17095 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmga1P17095 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmga1P17095 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms