Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ca3P16015 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca3P16015 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca3P16015 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms