Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd44P15379 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd44P15379 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd44P15379 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms