Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Calb1P12658 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms