Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms