Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt8P11679 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms