Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms