Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolP11369 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolP11369 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolP11369 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolP11369 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms