Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb4P10284 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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