Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp28P10078 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp28P10078 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms