Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Schip1P0DPB4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms