Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CatspereP0DP43 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms