Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms