Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254aP0DN89 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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