Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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