Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NefmP08553 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NefmP08553 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefmP08553 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefmP08553 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefmP08553 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefmP08553 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefmP08553 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefmP08553 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefmP08553 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NefmP08553 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefmP08553 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NefmP08553 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NefmP08553 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms