Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms