Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04214 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P04214 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04214 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04214 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04214 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04214 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04214 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms