Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-AaP01910 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms