Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01800 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01800 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01800 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01800 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01800 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms